Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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