Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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