Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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