Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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