Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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