Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms