Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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STRN3Q13033 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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STRN3Q13033 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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