Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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