Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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