Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HSPB3Q12988 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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