Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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