Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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