Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NFIAQ12857 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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NFIAQ12857 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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