Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms