Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
POLEQ07864 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms