Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms