Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSME1Q06323 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms