Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms