Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN1Q04323 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms