Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms