Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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