Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms