Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSCP56915 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSCP56915 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSCP56915 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms