Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AIF1P55008 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AIF1P55008 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms