Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB27AP51159 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms