Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms