Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSNK1EP49674 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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