Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCLMP48507 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms