Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB2P47870 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms