Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms