Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AFMP43652 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AFMP43652 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AFMP43652 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AFMP43652 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AFMP43652 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
AFMP43652 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AFMP43652 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms