Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms