Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms