Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms