Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms