Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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