Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDCP19113 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDCP19113 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDCP19113 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms