Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms