Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP2AP11388 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms