Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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