Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms