Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCC1O94876 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC1O94876 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms