Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OFD1O75665 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OFD1O75665 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OFD1O75665 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OFD1O75665 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OFD1O75665 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
OFD1O75665 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OFD1O75665 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OFD1O75665 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms