Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAK2O60296 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms