Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALUO43852 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALUO43852 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALUO43852 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALUO43852 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALUO43852 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALUO43852 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALUO43852 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALUO43852 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALUO43852 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms