Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGTAO43765 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGTAO43765 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGTAO43765 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGTAO43765 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGTAO43765 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SGTAO43765 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGTAO43765 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGTAO43765 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGTAO43765 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGTAO43765 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGTAO43765 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGTAO43765 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGTAO43765 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGTAO43765 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGTAO43765 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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