Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms