Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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