Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms