Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF10AO00220 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms